青海大学土木水利学院成立于2023年8月，由前青海大学水利电力学院和青海大学土木工程学院重组而成，最早可追溯至建立于1973年的青海工农学院水电系。

1973年，根据青海省水电行业发展的需求成立水电系，设置“农田水利工程”专业。此后十年期间得到快速发展，并积极培育“工业与民用建筑”专业。

1984年，根据青海省建筑行业的需求成立建筑工程系，设置工业与民用建筑专业并开始招生。

1988年，更名为青海大学水电系和青海大学建筑工程系。设置“水利水电工程”专业，撤销“农田水利工程”专业。

1989年，青海大学建筑工程系设置“给水排水”专业（专科）。

1994年，获批水利水电工程省级重点学科；建筑工程系设置“采暖通风空调”专业（专科）。

1997年，“工业与民用建筑”专业更名为“建筑工程”专业。

1998年，水电系设置“电气工程及其自动化专业”。

1999年，建筑工程专业调整为“土木工程”专业（建筑工程方向），并设置“城市规划”专业。

2000年和2004年，“土木工程”专业分别增设“交通土建”方向和“工程管理”方向；获批土木工程省级重点学科。

2007年，由水电系培育的“地质工程系”成立。

2010年，更名为青海大学水利电力学院和青海大学土木工程学院。同年，水利电力学院开设“水文与水资源工程” 专业和“农业水利工程”专业；土木工程学院招收“建筑工程”方向专升本学生。

2011年，获批水利工程一级学科硕士学位点及“水利水电工程”专业入选教育部卓越工程教育培养计划。

2013年，专业调整为“给排水科学与工程”专业和“城乡规划”专业。

2014年，获批“建筑与土木工程”专业型硕士学位点。

2017年，设置“工程管理”专业，撤销“土木工程”（工程管理方向）。

2018年，“建筑与土木工程”专业型硕士学位点变更为“土木水利”类别土木工程专业型硕士学位点。

2019年，获批土木工程一级学科硕士学位点和“青海省建筑节能材料与工程安全重点实验室”；撤销“水文与水资源工程” 专业和“农业水利工程”专业。

2020年，获批“黄河上游生态保护与高质量发展实验室”（省实验室）；增设“土木水利”类别水利工程专业型硕士学位点。

2021年，获批水利工程一级学科博士学位点。

2022年，获批“水利部江河源区水生态治理与保护重点实验室”。

2023年，水利电力学院水利工程学科和土木工程学院重新组建为青海大学土木水利学院；水利工程学科入选省级高校II类重点学科。

2024年，水利工程学科入选国内一流建设行列。

青海大学土木水利学院的成立是青海大学“十四五”期间学科建设的重要举措之一，是以水利工程一级学科博士点建设为指引，推动水利工程和土木工程学科交叉融发展的有力保障。未来土木水利学院将成为西北地区乃至全国重要的水利和土木人才培养基地，为国家战略和地方经济社会发展贡献青大力量。